RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 CDIP1Q9H305 208 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 C15orf56Q8N910 161 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00588Q9Y4M8 146 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1B0GX51 115 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 DNAL4O96015 105 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 BAALC-AS2P0C853 105 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 SCGB1A1P11684 91 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 UPK3BQ9BT76 320 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD9-201ENST00000249499 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 A0A087WYN8 130 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 S100A7L2Q5SY68 101 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 Q8NDZ9 215 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 NCR3O14931 201 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 Q6ZRU5 148 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 RMI2Q96E14 147 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD9-201ENST00000249499 IGLV6-57P01721 117 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 Q9HAA7 133 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 LECT2O14960 151 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 B9D2Q9BPU9 175 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00167Q96N53 147 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 C22orf24Q9Y442 160 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 TGP01266 2768 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 XGP55808 180 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 SNCGO76070 127 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 INAFM2P0DMQ5 153 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 SYCNQ0VAF6 134 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 C6orf99Q4VX62 202 aa15.08■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 ORMDL1Q9P0S3 153 aa15.08■□□□□ 0.01
HOXD9-201ENST00000249499 ACYP1P07311 99 aa15.08■□□□□ 0
HOXD9-201ENST00000249499 Q8N814 137 aa15.08■□□□□ 0
HOXD9-201ENST00000249499 COL7A1Q02388 2944 aa15.07■□□□□ 0
HOXD9-201ENST00000249499 MT-ATP8P03928 68 aa15.07■□□□□ 0
HOXD9-201ENST00000249499 VPREB1P12018 145 aa15.06■□□□□ 0
HOXD9-201ENST00000249499 TLX1NBP0CAT3 122 aa15.04■□□□□ -0
HOXD9-201ENST00000249499 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa15.03■□□□□ -0
HOXD9-201ENST00000249499 M0R378 163 aa15.03■□□□□ -0
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00575Q6W349 94 aa15.03■□□□□ -0
HOXD9-201ENST00000249499 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.02■□□□□ -0
HOXD9-201ENST00000249499 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 USP17L23D6RBM5 183 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 Q6ZRP5 223 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa15□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 DIRC1Q969H9 104 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 APLNQ9ULZ1 77 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 GAGE2EQ4V326 116 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 SLPIP03973 132 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 hADV29S1A0JD25 119 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 H3BQ85 93 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 CASC10Q5T4H9 136 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 COX7BP24311 80 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 Q6Q795 121 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 NUPR2A6NF83 97 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD9-201ENST00000249499 GAGE2BQ13066 116 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 GHRHP01286 108 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 C14orf132Q9NPU4 83 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 TTC32Q5I0X7 151 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00643Q86TS7 51 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD9-201ENST00000249499 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1B0GV72 72 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 Q6ZQY7 126 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 C7orf33Q8WU49 177 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 CCKP06307 115 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 C14orf177Q52M58 125 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 IMUPQ9GZP8 106 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 PSCAO43653 123 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXD9-201ENST00000249499 PRYO14603 147 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 234.1 ms