RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0087Q14695 138 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TGP01266 2768 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM13P0DJ93 91 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 SPAG11BQ08648 103 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 RNF151Q2KHN1 245 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 C14orf177Q52M58 125 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 LITAFQ99732 161 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 Q9HAA7 133 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00158P58513 81 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 ERG28Q9UKR5 140 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 BATFQ16520 125 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 CASC10Q5T4H9 136 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GWB2 263 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 PSCAO43653 123 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf56Q8N910 161 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0B4J2C4 111 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 USP17L23D6RBM5 183 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 FXYD2P54710 66 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 SYCNQ0VAF6 134 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf82Q6UX34 121 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 A4D1N5 150 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 EREGO14944 169 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFC2O95298 119 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 PFN2P35080 140 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 RAB37Q96AX2 223 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-211ENST00000425989 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 CFC1BP0CG36 223 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 CFC1P0CG37 223 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZR54 194 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf223Q8N319 242 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf118A6NHY6 69 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0U1RRA0 63 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 TAX1BP3O14907 124 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 LY6G6CO95867 125 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf25Q5T742 122 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZRU5 148 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 CARD19Q96LW7 228 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 DAND5Q8N907 189 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 COX6CP09669 75 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-211ENST00000425989 TENM2Q9NT68 2774 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 M0R2N4 97 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 FABP2P12104 132 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 NPC2P61916 151 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM126AQ9H061 195 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 SLPIP03973 132 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PPM0 123 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 H3BUT2 72 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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