RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1B0GV50	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651		H7C423	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPS	P0C0P6	89 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	FABP4	P15090	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCAP	O15273	167 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	TWIST1	Q15672	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651		C9JQL5	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0R2T5	61 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NCR2	O95944	276 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MB	P02144	154 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRGC2	P03986	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1B0GV90	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0R143	59 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFA1	O15239	70 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	PMCH	P20382	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTRL	P40313	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FHIT	P49789	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERF2	P84101	59 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZUT4	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651		I3L3M4	83 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUPR1	O60356	82 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCE1	O60756	84 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADIRF	Q15847	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	VCX2	Q9H322	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAND5	Q8N907	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	NRAC	Q8N912	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDE6D	O43924	150 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms