RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SPINK8P0C7L1 97 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 CKS2P33552 79 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 ORMDL3Q8N138 153 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TMEM126AQ9H061 195 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 D6R8Y8 96 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 I3L3M4 83 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 GAS8-AS1O95177 125 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SMIM13P0DJ93 91 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 LAGE3Q14657 143 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SMKR1H3BMG3 65 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 H7C423 109 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 VCYO14598 125 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TNFRSF6BO95407 300 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 HSPG2P98160 4391 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 A0A087WX48 190 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GUV1 79 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TMEM262E9PQX1 116 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 LEPROTL1O95214 131 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 NFE4Q86UQ8 179 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TMEM243Q9BU79 118 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TSHBP01222 138 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 NPYP01303 97 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 PRELID3AQ96N28 172 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 KIR2DL4Q99706 377 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 C16orf90A8MZG2 172 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 UBE2L6O14933 153 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-30P01768 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-33P01772 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 LINC01545Q5VT33 79 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 hDV102S1A0JD36 115 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 B5MCH6 92 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 K7EMI3 77 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 HIGD1BQ9P298 99 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 H3BMG7 143 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 FCER1GP30273 86 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 Q6Q795 121 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZUT4 128 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 Q8N3U1 123 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 PRR34Q9NV39 138 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 APOMO95445 188 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 Q8N8P6 123 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 RMI2Q96E14 147 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 A4D1N5 150 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 FGF6P10767 208 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP10-2P60368 255 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 FOXI1Q12951 378 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 TAL2Q16559 108 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 MIAQ16674 131 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 TM2D2Q9BX73 214 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 KLK12Q9UKR0 248 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 E9PLD3 99 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 CDK2AP2O75956 126 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 CRPP02741 224 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 GCSHP23434 173 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 ENHOQ6UWT2 76 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 LINC01546A6NGU7 62 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 RAB37Q96AX2 223 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 UBE2WQ96B02 151 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 TMEM101Q96IK0 257 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 CDIP1Q9H305 208 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-209ENST00000580646 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GWB2 263 aa6.58□□□□□ -1.36
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