RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 BPY2O14599 106 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 GAS8-AS1O95177 125 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC7Q8TAX7 377 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf33Q8WU49 177 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 MTORP42345 2549 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MZ25 164 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIAP1O43715 76 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A096LNI7 61 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R378 163 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 B5MCH6 92 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8IZM0 81 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 IGIPA6NJ69 53 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 G3V4G9 280 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 COX17Q14061 63 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R2N4 97 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 SLPIP03973 132 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.79□□□□□ -0.52
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SH3BP4-201ENST00000344528 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LY6G6CO95867 125 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 NUPR2A6NF83 97 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 UPK3BQ9BT76 320 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf91Q6ZV80 131 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZQY7 126 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 RETNQ9HD89 108 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 FHL2Q14192 279 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 CCKP06307 115 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZTC4 211 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 LST1O00453 97 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8N2B8 174 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAMTS20P59510 1910 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00310P59036 64 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV4-1P06312 121 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 POLQO75417 2590 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf47Q569G3 176 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 EML5Q05BV3 1969 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00694P0DN24 101 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 AMELXQ99217 191 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 SCXQ7RTU7 201 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GUV1 79 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.65□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 ENHOQ6UWT2 76 aa11.65□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 ACANP16112 2415 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf84H3BNL1 204 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-ATP8P03928 68 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 M0QXV9 152 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 COX6A2Q02221 97 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 USP17L23D6RBM5 183 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 F8WDY8 70 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 J3KT08 172 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZSN1 163 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 C20orf197Q8N268 126 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 COL4A2P08572 1712 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf223Q8N319 242 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A096LNJ9 63 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCRQO14949 82 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-201ENST00000344528 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
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