RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		A0A087WZ39	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	LELP1	Q5T871	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	UBE2D3	P61077	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		H0Y9J4	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		A0A0B4J2C4	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		Q8N976	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		J3KT08	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	DAND5	Q8N907	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	LECT2	O14960	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		A0A0J9YWU9	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		A0A1B0GXF2	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	COL4A2	P08572	1712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	PRY	O14603	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		M0QY20	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	COX17	Q14061	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649		H3BT86	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	BRI3	O95415	125 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-240	ENST00000617649	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	KLLN	B2CW77	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649		A0A0J9YXY3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649		M0R2N4	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	CDSN	Q15517	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649		U3KQK5	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649		Q6ZPA2	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	SMR3A	Q99954	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	ACAN	P16112	2415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	RBX1	P62877	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-240	ENST00000617649		V9GYY9	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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