RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 NFE4Q86UQ8 179 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0J9YY99 117 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00587B1AMM8 73 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZUT4 128 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf86A6NJI1 115 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2L6O14933 153 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 HTN3P15516 51 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 C14orf144Q96I85 54 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 COX8AP10176 69 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 MRAPQ8TCY5 172 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZTC4 211 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5A1Q8NGJ0 315 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM101Q96IK0 257 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A096LPF7 62 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 DLEU1O43261 78 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0J9YXV3 536 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2D1P51668 147 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 TIRAPP58753 221 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE6Q13070 117 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 B9D2Q9BPU9 175 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 E9PLD3 99 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 BOD1L2Q8IYS8 172 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GUV1 79 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 NMUP48645 174 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 HERVK_113P61574 105 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 LELP1Q5T871 98 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 TENM3Q9P273 2699 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM223A0PJW6 202 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFA6Q01524 100 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 PCP2Q8IVA1 136 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 SIVA1O15304 175 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 TCTAP57738 103 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC11AP67812 179 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 LYPD5Q6UWN5 251 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 RBX1P62877 108 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 HERVK_113P63121 156 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAG1AP78358 180 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM262E9PQX1 116 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 LEPROTO15243 131 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 MPV17L2Q567V2 206 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 HIGD1BQ9P298 99 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 COX6A2Q02221 97 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BRM9 83 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00469Q8N7U9 141 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R143 59 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL25O15444 150 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 J3QQQ9 107 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 ESRGQ1W209 222 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF815PA8K554 130 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 EREGO14944 169 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 SPINK8P0C7L1 97 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.54■□□□□ 0.08
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