RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRM-201ENST00000332175 CLUHP3Q96NS8 147 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-201ENST00000332175 J3KT08 172 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-201ENST00000332175 RNF185Q96GF1 192 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-201ENST00000332175 DSCAML1Q8TD84 2053 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRM-201ENST00000332175 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRM-201ENST00000332175 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRM-201ENST00000332175 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRM-201ENST00000332175 CD164L2Q6UWJ8 174 aa16.45■□□□□ 0.22
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PTPRM-201ENST00000332175 IGLV1-40P01703 118 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-201ENST00000332175 WFDC13Q8IUB5 93 aa16.39■□□□□ 0.21
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PTPRM-201ENST00000332175 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2D3P61077 147 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZQY7 126 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 GAS8-AS1O95177 125 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 PCNX3Q9H6A9 2034 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 PLAC8L1A1L4L8 177 aa16.37■□□□□ 0.21
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PTPRM-201ENST00000332175 SMIM11BQ8TCY0 68 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRM-201ENST00000332175 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa16.34■□□□□ 0.21
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PTPRM-201ENST00000332175 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 SNURFQ9Y675 71 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFA7O95182 113 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 BRI3O95415 125 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2D2P62837 147 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRM-201ENST00000332175 CYSRT1A8MQ03 144 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 PRR4Q16378 134 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRQO14949 82 aa16.26■□□□□ 0.19
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