RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 CCDC175P0C221 793 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 GUCY2CP25092 1073 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 RAI14Q9P0K7 980 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 JMYQ8N9B5 988 aa11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 MYH8P13535 1937 aa11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.69e-6■■■■□ 20.6
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HCG18-242ENST00000602319 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 VPS18Q9P253 973 aa11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 STK36Q9NRP7 1315 aa11.31□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.31□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 CASP8Q14790 479 aa11.31□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 NBPF3Q9H094 633 aa11.29□□□□□ -0.6
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HCG18-242ENST00000602319 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 MFAP3LO75121 409 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 CIAO1O76071 339 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 POSTNQ15063 836 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-242ENST00000602319 NTRK3Q16288 839 aa11.29□□□□□ -0.6
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