RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 C17orf99Q6UX52 265 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 LPIN2Q92539 896 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 APBB1O00213 710 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMC4P43686 418 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 SNAPC2Q13487 334 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2B3Q16720 1220 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 ERO1BQ86YB8 467 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM47Q96LD4 638 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC5A1P13866 664 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 FGFR2P21802 821 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 CTGFP29279 349 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TNNI3KQ59H18 835 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR153Q6NV75 609 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 EVI5O60447 810 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF5LO75529 589 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 OSBPP22059 807 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 JAG2Q9Y219 1238 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TNNI2P48788 182 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 UBXN2AP68543 259 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 STAP2Q9UGK3 403 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GUL7 405 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 IRF6O14896 467 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 CPA4Q9UI42 421 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 MYPNQ86TC9 1320 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 PPIL2Q13356 520 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 AACSQ86V21 672 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 SGPL1O95470 568 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPN2P17655 700 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB123Q8N688 67 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 LNPKQ9C0E8 428 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB22O15209 634 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD23Q86SG2 305 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 GPATCH3Q96I76 525 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 WRNIP1Q96S55 665 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC80Q8N2C7 3258 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP8BP34820 402 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM10P62072 90 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 XAGE2Q96GT9 111 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRA2Q96PE1 1338 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 PPATQ06203 517 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 GORABQ5T7V8 394 aa28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-214ENST00000592483 CRKP46108 304 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCZQ05513 592 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 GDF15Q99988 308 aa28.72■■■□□ 2.19
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CAPNS1-214ENST00000592483 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.71■■■□□ 2.19
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CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.7■■■□□ 2.19
CAPNS1-214ENST00000592483 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 MX1P20591 662 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ADORA1P30542 326 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS37DQ86XT2 251 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 Q7L0L9 218 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA3EO15041 775 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ERC2O15083 957 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-214ENST00000592483 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.68■■■□□ 2.18
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