RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 OLFM4Q6UX06 510 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF384Q8TF68 577 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX11Q8IYF3 940 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ME3Q16798 604 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC51AQ86UW1 340 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 PFKFB2O60825 505 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 EVCP57679 992 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 AOC3Q16853 763 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCA1Q86XH1 822 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF3C6Q969F1 213 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L12C9JPN9 530 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L21D6R901 530 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNA3P22001 575 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 CTR9Q6PD62 1173 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 B4E1Z4 1266 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 LIFRP42702 1097 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP14P50281 582 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 NIM1KQ8IY84 436 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC69A6NI79 296 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ORC4O43929 436 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 CDKL5O76039 1030 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 SNED1Q8TER0 1413 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM4AO75164 1064 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 APOBRQ0VD83 1088 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 DACT2Q5SW24 774 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF3Q9H094 633 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 RCAN1P53805 252 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R5BQ15173 497 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 NFKBIBQ15653 356 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC6Q86TZ1 520 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 JDP2Q8WYK2 163 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 NEDD4P46934 1319 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 CPLX1O14810 134 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 FGRP09769 529 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 GJB2P29033 226 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 STK3Q13188 491 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 WTAPQ15007 396 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 F8W031 263 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 CHST3Q7LGC8 479 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 NECAB1Q8N987 351 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMB1P07942 1786 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 LARGE1O95461 756 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 CRKP46108 304 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIK5Q16478 980 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf60Q5U649 245 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 OGFOD1Q8N543 542 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 USP40Q9NVE5 1235 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB43O43298 467 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms