RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAG3O95817 575 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLCG2P16885 1265 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJA5P36382 358 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZAP70P43403 619 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 AK9Q5TCS8 1911 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOCK2Q92608 1830 aa20.88■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.86■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K10Q02779 954 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 CERS3Q8IU89 383 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 OTUD5Q96G74 571 aa20.86■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP4CP60510 307 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 PICALMQ13492 652 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 APBB1O00213 710 aa20.84■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PPIL2Q13356 520 aa20.84■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX11Q8IYF3 940 aa20.84■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR25O00155 361 aa20.83■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 INPP5BP32019 993 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K12Q12852 859 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.83■□□□□ 0.93
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CETPP11597 493 aa20.82■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL15Q16663 113 aa20.82■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPN18Q99952 460 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRF6O14896 467 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKTNO75072 461 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP7A1P22680 504 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCTPP1Q9H773 170 aa20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 PICK1Q9NRD5 415 aa20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP5JP18859 108 aa20.78■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.78■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.78■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SOX10P56693 466 aa20.77■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-211ENST00000567434 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 FLT1P17948 1338 aa20.77■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXCL11O14625 94 aa20.76■□□□□ 0.91
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CCNDBP1-211ENST00000567434 DOCK1Q14185 1865 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLIM4O00461 696 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRAP18433 802 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 AAMPQ13685 434 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERO1AQ96HE7 468 aa20.74■□□□□ 0.91
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