RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 IGSF3O75054 1194 aa20.41■□□□□ 0.86
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PACS1-208ENST00000529677 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.4■□□□□ 0.86
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PACS1-208ENST00000529677 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.4■□□□□ 0.86
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PACS1-208ENST00000529677 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.4■□□□□ 0.86
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PACS1-208ENST00000529677 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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PACS1-208ENST00000529677 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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PACS1-208ENST00000529677 JAG2Q9Y219 1238 aa20.34■□□□□ 0.85
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PACS1-208ENST00000529677 NBPF11Q86T75 865 aa20.33■□□□□ 0.85
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PACS1-208ENST00000529677 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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PACS1-208ENST00000529677 CTGFP29279 349 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K12Q12852 859 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.31■□□□□ 0.84
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PACS1-208ENST00000529677 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ZNF384Q8TF68 577 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 OPTNQ96CV9 577 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 FSD1Q9BTV5 496 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ELP3Q9H9T3 547 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ABCF2Q9UG63 623 aa20.31■□□□□ 0.84
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PACS1-208ENST00000529677 CLRN2A0PK11 232 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 MMP14P50281 582 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 DPF3Q92784 378 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 RILPL2Q969X0 211 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 MRIQ9BWK5 157 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ALPK3Q96L96 1907 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 PDE6AP16499 860 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ADD2P35612 726 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 MECOMQ03112 1051 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 UBE3CQ15386 1083 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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