RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522115.6

PTPN12-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 5

Gene PTPN12, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-215	ENST00000522115	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	NFIC	P08651	508 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	RXRB	P28702	533 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	GATA6	Q92908	595 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	FANCG	O15287	622 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	RAB6A	P20340	208 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	VAMP1	P23763	118 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	NTF4	P34130	210 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PWP1	Q13610	501 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	NEFM	P07197	916 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	XP32	Q5T750	250 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	RHOV	Q96L33	236 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN12-215	ENST00000522115	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	F13B	P05160	661 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	LMNB1	P20700	586 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	LMNB2	Q03252	620 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	HDX	Q7Z353	690 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ISL2	Q96A47	359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ADM	P35318	185 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	CYP27A1	Q02318	531 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	INPP5A	Q14642	412 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	GFRA2	O00451	464 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	CD97	P48960	835 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	LRP8	Q14114	963 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	RELL1	Q8IUW5	271 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	CAP2	P40123	477 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	SEPT6	Q14141	434 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM221A	A4D161	298 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	COBL	O75128	1261 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	TGFB1	P01137	390 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	GRIK1	P39086	918 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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