RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.51■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.51■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CEP350Q5VT06 3117 aa21.51■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 PDE4AP27815 886 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 DCAF15Q66K64 600 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 EVI5LQ96CN4 794 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CAPNS2Q96L46 248 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CHGBP05060 677 aa21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 MAP3K10Q02779 954 aa21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC102AQ96A19 550 aa21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CSRNP1Q96S65 589 aa21.49■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 DOCK2Q92608 1830 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 TICAM2Q86XR7 235 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.48■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 USP5P45974 858 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 MAP3K9P80192 1104 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 JMYQ8N9B5 988 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 FSD1Q9BTV5 496 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 FLT1P17948 1338 aa21.47■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 LCORLQ8N3X6 602 aa21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 APPBP2Q92624 585 aa21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ARMT1Q9H993 441 aa21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.46■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
SMIM4-202ENST00000476842 TBC1D12O60347 775 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 MBD4O95243 580 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 SLC10A3P09131 477 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 MAP2K2P36507 400 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 OSBP2Q969R2 916 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 AIDAQ96BJ3 306 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.44■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 NOGQ13253 232 aa21.44■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 GRM1Q13255 1194 aa21.44■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.44■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.44■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.44■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.43■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 WRNIP1Q96S55 665 aa21.43■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 PALD1Q9ULE6 856 aa21.43■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 AOC2O75106 756 aa21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 RILPL2Q969X0 211 aa21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 CSADQ9Y600 493 aa21.42■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 PRKAB2O43741 272 aa21.41■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 VGLL4Q14135 290 aa21.41■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.41■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 18.5
SMIM4-202ENST00000476842 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 HLA-DOAP06340 250 aa21.4■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 SLURP2P0DP57 97 aa21.4■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 SPRYD7Q5W111 196 aa21.4■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 TTC6Q86TZ1 520 aa21.4■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.4■■□□□ 1.02
SMIM4-202ENST00000476842 M0R2C6 588 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 GPAA1O43292 621 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 INPP5BP32019 993 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 TTC22Q5TAA0 569 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 ZIC5Q96T25 663 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 ELP3Q9H9T3 547 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM4-202ENST00000476842 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.39■■□□□ 1.01
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