RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	POTEC	B2RU33	542 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP17L21	D6R901	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF213	O14771	459 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	HSPA4	P34932	840 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CACNB3	P54284	484 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	NFIA	Q12857	509 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	SCN4A	P35499	1836 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC27A2	O14975	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TCP10	Q12799	353 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	UTRN	P46939	3433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANAPC15	P60006	121 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPARA	Q07869	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT32	Q14532	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASA3	Q14644	834 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNB2	Q92953	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CYP21A2	P08686	494 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	NT5C2	P49902	561 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	HAND2	P61296	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDE4B	Q07343	736 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRDN	Q13061	729 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CYP2D6	P10635	497 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	PSMA5	P28066	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLCD1	P51178	756 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	EHD4	Q9H223	541 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBC1D12	O60347	775 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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