RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CCL15Q16663 113 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 LAMB1P07942 1786 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D12O60347 775 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 BAG3O95817 575 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 PLCG2P16885 1265 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 RGS19P49795 217 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 COG6Q9Y2V7 657 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 IRF6O14896 467 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CRHR2Q13324 411 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 INPP5BP32019 993 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 PPP4CP60510 307 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CERS3Q8IU89 383 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 ERO1AQ96HE7 468 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 RAB11FIP3O75154 756 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 CXCL11O14625 94 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF6Q15052 776 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 SNRKQ9NRH2 765 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 ZAP70P43403 619 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 SP3Q02447 781 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 PICALMQ13492 652 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 OTOFQ9HC10 1997 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 AACSQ86V21 672 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 PICK1Q9NRD5 415 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 TEX11Q8IYF3 940 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 BTBD19C9JJ37 291 aa24.79■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 TLR2O60603 784 aa24.79■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 PTPRAP18433 802 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 MAP3K12Q12852 859 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX3-201ENST00000370002 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 TRIM17Q9Y577 477 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 EFCC1Q9HA90 598 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 GNRH1P01148 92 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 CYP7A1P22680 504 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 MOGSQ13724 837 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 GINM1Q9NU53 330 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 PDHXO00330 501 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX3-201ENST00000370002 KIF22Q14807 665 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms