RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L12C9JPN9 530 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L21D6R901 530 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 PDE6BP35913 854 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 MYL10Q9BUA6 226 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY1B3Q02153 619 aa26.65■■□□□ 1.86
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VSTM4-201ENST00000298454 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB43O43298 467 aa26.65■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF445P59923 1031 aa26.65■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2HP62256 183 aa26.65■■□□□ 1.86
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VSTM4-201ENST00000298454 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.65■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.65■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 LTBP1Q14766 1721 aa26.65■■□□□ 1.86
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VSTM4-201ENST00000298454 SLC15A2Q16348 729 aa26.64■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 TTC6Q86TZ1 520 aa26.64■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.64■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.63■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 ALDH1B1P30837 517 aa26.63■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 ESR2Q92731 530 aa26.63■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.63■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF3O75054 1194 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM1O75626 825 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 WTAPQ15007 396 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 MASTLQ96GX5 879 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 MRE11P49959 708 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 GSTO1P78417 241 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 ERICH2A1L162 156 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2D6P10635 497 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.61■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 MPNDQ8N594 471 aa26.6■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.6■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 MTA3Q9BTC8 594 aa26.6■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 NTRK3Q16288 839 aa26.58■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 PHKBQ93100 1093 aa26.58■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 STK32BQ9NY57 414 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 BAG3O95817 575 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L8P0C7I0 530 aa26.58■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 SBK1Q52WX2 424 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA32Q96LK8 384 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM4-201ENST00000298454 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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VSTM4-201ENST00000298454 USP5P45974 858 aa26.57■■□□□ 1.84
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VSTM4-201ENST00000298454 PANK2Q9BZ23 570 aa26.57■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
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VSTM4-201ENST00000298454 GTF2IP78347 998 aa26.57■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 TMTC2Q8N394 836 aa26.57■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.56■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 AIFM3Q96NN9 605 aa26.56■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 COA1Q9GZY4 146 aa26.56■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.55■■□□□ 1.84
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