RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 MLKLQ8NB16 471 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 NBPF4Q96M43 638 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 RTL9Q8NET4 1388 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 A6NNZ2 444 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 ATP5JP18859 108 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 GNAT2P19087 354 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 SMC6Q96SB8 1091 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 LDHCP07864 332 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 ZSCAN26Q16670 478 aa20.99■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 KLHL34Q8N239 644 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM87BQ96K49 555 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 STIM2Q9P246 746 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 CALML3P27482 149 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 NEK11Q8NG66 645 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 BICDL2A1A5D9 508 aa20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 A0A087WWV3 80 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 CALM1P0DP23 149 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 CALM2P0DP24 149 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 CALM3P0DP25 149 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 PFKFB1P16118 471 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 SETDB1Q15047 1291 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 BEND3Q5T5X7 828 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 GNAQP50148 359 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 STAMQ92783 540 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 DEXIO95424 95 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 POSTNQ15063 836 aa20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 PBRM1Q86U86 1689 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 ARMT1Q9H993 441 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 DESI2Q9BSY9 194 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 DAAM2Q86T65 1068 aa20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PRKCI-201ENST00000295797 ADAMTS2O95450 1211 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 KRT9P35527 623 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 MAP3K9P80192 1104 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 C6orf229H3BNL8 230 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ATP2A1O14983 1001 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF853P0CG23 659 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 MAP4K1Q92918 833 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.95■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 LARGE1O95461 756 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 C8orf74Q6P047 294 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGEF10O15013 1369 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC174Q6PII3 467 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 PFKFB2O60825 505 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGAP25P42331 645 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ZAP70P43403 619 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 PLA2R1Q13018 1463 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 IFT74Q96LB3 600 aa20.94■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 PRDM1O75626 825 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 NDUFA8P51970 172 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC25Q86WR0 208 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ERMNQ8TAM6 284 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 A1BGP04217 495 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 ITGA6P23229 1130 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 SCRN1Q12765 414 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.93■□□□□ 0.94
PRKCI-201ENST00000295797 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms