RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 HOOK2Q96ED9 719 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D8O95759 1140 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 INHBEP58166 350 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 OPTNQ96CV9 577 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 IDI2Q9BXS1 227 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 SNRKQ9NRH2 765 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.14■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 BTDP43251 543 aa22.14■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.14■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.14■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 WRNIP1Q96S55 665 aa22.14■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 LAMB1P07942 1786 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 DCAF15Q66K64 600 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 IFNL1Q8IU54 200 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ABHD8Q96I13 439 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 RAI14Q9P0K7 980 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 CSADQ9Y600 493 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ERC2O15083 957 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ENTPD3O75355 529 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ATP5JP18859 108 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 RHBDL3P58872 404 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 GSTO1P78417 241 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ALDH1A1P00352 501 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 DGKZQ13574 1117 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 TTC22Q5TAA0 569 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 PTPN18Q99952 460 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 LDHCP07864 332 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 INPP5BP32019 993 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ZAP70P43403 619 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 OTUD5Q96G74 571 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 GPR25O00155 361 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 ERO1BQ86YB8 467 aa22.09■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 PICALMQ13492 652 aa22.08■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTX4-201ENST00000293922 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 GTF2A2P52657 109 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 HTTP42858 3142 aa22.07■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K10Q02779 954 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 HAUS7Q99871 368 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 IRF6O14896 467 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 PPIL2Q13356 520 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 CCL15Q16663 113 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.06■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.05■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 IGSF3O75054 1194 aa22.05■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 SLURP2P0DP57 97 aa22.05■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 AK9Q5TCS8 1911 aa22.05■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 DOCK2Q92608 1830 aa22.04■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 PPATQ06203 517 aa22.04■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 CRHR2Q13324 411 aa22.04■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 TEX11Q8IYF3 940 aa22.04■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 FKTNO75072 461 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 SDSP20132 328 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 PPP4CP60510 307 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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