RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251091.9

SAMD4A-201, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4A, Length 6,565 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4A-201ENST00000251091 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CCDC172P0C7W6 258 aa14.62□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 KRT5P13647 590 aa14.62□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.62□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.62□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.62□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 ITGA6P23229 1130 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 PEX19P40855 299 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 ALDH1L1O75891 902 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 VAV2P52735 878 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 SH2D4AQ9H788 454 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 RMND1Q9NWS8 449 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 BANK1Q8NDB2 785 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 FLT4P35916 1363 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 PPME1Q9Y570 386 aa14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 A0A1B0GUA9 196 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 H7C1D1 291 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CNGA1P29973 690 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 TYRO3Q06418 890 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 NEK11Q8NG66 645 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CUL7Q14999 1698 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 RTL1A6NKG5 1358 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MBD4O95243 580 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 A1BGP04217 495 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 INPP5BP32019 993 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 HDXQ7Z353 690 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CXorf38Q8TB03 319 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 DDX12PQ92771 950 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 VCX3BQ9H321 246 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 SWAP70Q9UH65 585 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 TTC22Q5TAA0 569 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 LRRC45Q96CN5 670 aa14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 INF2Q27J81 1249 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 PRR16Q569H4 304 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 POLKQ9UBT6 870 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 PSMA7O14818 248 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MAP3K5Q99683 1374 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 SMIM24O75264 130 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 IP6K1Q92551 441 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 E7EVH7 732 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 KRT79Q5XKE5 535 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 HINFPQ9BQA5 517 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 LINS1Q8NG48 757 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 GNAT2P19087 354 aa14.58□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 CALCOCO2Q13137 446 aa14.58□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.58□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SAMD4A-201ENST00000251091 SESN3P58005 492 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 KRT83P78385 493 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 GBP1P32455 592 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 OGFRQ9NZT2 677 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 FAM182BQ5T319 152 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.58□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 KIFC2Q96AC6 838 aa14.57□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 DLGAP5Q15398 846 aa14.57□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 ELF2Q15723 593 aa14.57□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.57□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 VPS16Q9H269 839 aa14.57□□□□□ -0.08
SAMD4A-201ENST00000251091 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms