RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 MRIQ9BWK5 157 aa20.91■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.91■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.91■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM32Q13049 653 aa20.9■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.9■□□□□ 0.94
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM151AQ8WW52 585 aa20.9■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
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SPCS1-201ENST00000233025 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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SPCS1-201ENST00000233025 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SPCS1-201ENST00000233025 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.88■□□□□ 0.93
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SPCS1-201ENST00000233025 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.87■□□□□ 0.93
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SPCS1-201ENST00000233025 GJD2Q9UKL4 321 aa20.85■□□□□ 0.93
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SPCS1-201ENST00000233025 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.84■□□□□ 0.93
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SPCS1-201ENST00000233025 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.84■□□□□ 0.93
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SPCS1-201ENST00000233025 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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SPCS1-201ENST00000233025 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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SPCS1-201ENST00000233025 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.75■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 BEND3Q5T5X7 828 aa20.75■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.75■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB22O15209 634 aa20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2B6P20813 491 aa20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 SHHQ15465 462 aa20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-201ENST00000233025 USP38Q8NB14 1042 aa20.74■□□□□ 0.91
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