RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	RBX1	P62877	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	HAMP	P81172	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	MGP	P08493	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	CTRL	P40313	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	SST	P61278	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1B0GUV1	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	GZMB	P10144	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	GAGE6	Q13070	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	NTF3	P20783	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	REG3A	Q06141	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	COTL1	Q14019	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	UBE2L6	O14933	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	PRSS1	P07477	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	VPREB1	P12018	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	AMT	P48728	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	TWIST1	Q15672	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301		A8MWL6	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301		H7C423	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	NCR2	O95944	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	NPS	P0C0P6	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301		K7EN84	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	PRY	O14603	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	OXT	P01178	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	APCS	P02743	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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