RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 COTL1Q14019 142 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 UBE2L6O14933 153 aa9.78□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 PRSS1P07477 247 aa9.78□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.78□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.78□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.78□□□□□ -0.84
CTIF-203ENST00000587752 A8MWL6 223 aa9.77□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 FAM210AQ96ND0 272 aa9.76□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.76□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 A0A1B0GUV1 79 aa9.75□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 ZNF727A8MUV8 499 aa9.75□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 LINC01551Q86U37 167 aa9.75□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.75□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.74□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 BORCS7Q96B45 105 aa9.74□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.73□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 GAS8-AS1O95177 125 aa9.73□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 CT83Q5H943 113 aa9.73□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 HIGD1CA8MV81 97 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 TSKUQ8WUA8 353 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-203ENST00000587752 A0A1B0GUT8 65 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 hDV102S1A0JD36 115 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 APCSP02743 223 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 TEX261Q6UWH6 196 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 OSTCQ9NRP0 149 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 NCR2O95944 276 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 PMCHP20382 165 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 C9JQL5 133 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 FGF6P10767 208 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 RNF185Q96GF1 192 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 V9GYV3 84 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 FAM231BA6NCW3 169 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 PANO1I0J062 215 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 I3L3M4 83 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 AMN1Q8IY45 258 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 ISOC2Q96AB3 205 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 ST20Q9HBF5 79 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 SMKR1H3BMG3 65 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 RAB4AP20338 218 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 ADIRFQ15847 76 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 J3QL48 77 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 TSHBP01222 138 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 SLPIP03973 132 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 RIGQ13278 110 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 NUP35Q8NFH5 326 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 H7C423 109 aa9.65□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.65□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 C15orf56Q8N910 161 aa9.65□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 MRAP2Q96G30 205 aa9.65□□□□□ -0.86
CTIF-203ENST00000587752 MYCBP2O75592 4640 aa9.65□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 ESDP10768 282 aa9.64□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 PEA15Q15121 130 aa9.64□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 TMEM101Q96IK0 257 aa9.64□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 BTF3L4Q96K17 158 aa9.64□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 NAT8Q9UHE5 227 aa9.64□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 CHTF8P0CG12 524 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 CFAP161Q6P656 301 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 DPH3Q96FX2 82 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CTIF-203ENST00000587752 XCL1P47992 114 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms