RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 RHOHQ15669 191 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TMEM223A0PJW6 202 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 HTN1P15515 57 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RNF183Q96D59 192 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 SORL1Q92673 2214 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 I3L3M4 83 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 ESM1Q9NQ30 184 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 ITPR3Q14573 2671 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 LEPROTO15243 131 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 GAGE5Q13069 117 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 GAGE6Q13070 117 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RAX2Q96IS3 184 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TENM4Q6N022 2769 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 A0A0J9YXV3 536 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 A4D1N5 150 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RHODO00212 210 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 A8MTW9 85 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 FHL3Q13643 280 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TEN1Q86WV5 123 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 DUX3Q96PT4 197 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 H7C2G1 150 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TMEM262E9PQX1 116 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 DEFB131AP59861 70 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 CHD6Q8TD26 2715 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 PROK1P58294 105 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 SPXQ9BT56 116 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 C16orf95Q9H693 158 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 KNCNA6PVL3 124 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 A8MWV9 139 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 CD28P10747 220 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 CARD19Q96LW7 228 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-205ENST00000578348 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 PRM2P04554 102 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-205ENST00000578348 H3BMM0 161 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 IGHV3-33P01772 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 PDZD2O15018 2839 aa8.32□□□□□ -1.08
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GGA3-205ENST00000578348 Q1RN00 199 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 CITED1Q99966 193 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 A0A0B4J2C4 111 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 C9JAW5 83 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 CCL24O00175 119 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 Q9UF83 564 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.31□□□□□ -1.08
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GGA3-205ENST00000578348 SLC25A20O43772 301 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 LINC01006Q8NI28 216 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 FAM104AQ969W3 186 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 A0A1W2PRX2 142 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 M0QXV9 152 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 B5MCH6 92 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 PRSS2P07478 247 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 HILS1P60008 231 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-205ENST00000578348 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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