RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE6	Q13070	117 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	RHEB	Q15382	184 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		6.18	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	C5orf52	A6NGY3	159 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	RBX1	P62877	108 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	TWIST1	Q15672	202 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	MIA	Q16674	131 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	RASL11A	Q6T310	242 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	NIT2	Q9NQR4	276 aa		6.17	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM250	H0YL14	139 aa		6.16	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479		K7EN84	100 aa		6.16	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01620	Q4KN68	170 aa		6.16	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	C14orf177	Q52M58	125 aa		6.16	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		6.16	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	S100A2	P29034	98 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	CTRL	P40313	264 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZSA8	131 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR34	Q9NV39	138 aa		6.15	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	COLCA2	A8K830	154 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	HLA-DQA1	P01909	254 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	ADCYAP1	P18509	176 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	CEBPG	P53567	150 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GUV1	79 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MWL6	223 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L23	D6RBM5	183 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2L6	O14933	153 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB5A	P20339	215 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	REG3A	Q06141	175 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	COTL1	Q14019	142 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		6.13	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00587	B1AMM8	73 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	AMT	P48728	403 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	TSTD3	H0UI37	97 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS1	P07477	247 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	SCX	Q7RTU7	201 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	BORCS7	Q96B45	105 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		6.11	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		6.1	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF727	A8MUV8	499 aa		6.1	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	CT83	Q5H943	113 aa		6.1	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		6.1	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.1	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	NCR2	O95944	276 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	PMCH	P20382	165 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01551	Q86U37	167 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.09	□□□□□ -1.43
KIFC3-231	ENST00000567479	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GUT8	65 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	HIGD1C	A8MV81	97 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479		H7C423	109 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479		I3L3M4	83 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R2P9	O14990	202 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	FAT1	Q14517	4588 aa		6.08	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		6.07	□□□□□ -1.44
KIFC3-231	ENST00000567479	hDV102S1	A0JD36	115 aa		6.07	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.1 ms