RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 RAB5BP61020 215 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 PRYO14603 147 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NRACQ8N912 160 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL4Q99706 377 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YY99 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE12JA6NER3 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 K7EMI3 77 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NPYP01303 97 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE1Q13065 139 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE4Q13068 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE5Q13069 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 I3L3M4 83 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 VCYO14598 125 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 P0DMU3 169 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 FAM231AP0DMU4 169 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 FAM231CP0DMU5 169 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 FCER1GP30273 86 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TCTAP57738 103 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2D3P61077 147 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2D2P62837 147 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 COTL1Q14019 142 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 FA2HQ7L5A8 372 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 BAGE3Q86Y29 109 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 NUDT3O95989 172 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00694P0DN24 101 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 G0S2P27469 103 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS47A8MTI9 375 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 IGLL5B9A064 214 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BKO60814 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BJP06899 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BOP23527 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BBP33778 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BDP58876 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 PKIAP61925 76 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BCP62807 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 Q0VG73 95 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N8P6 123 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 MUC7Q8TAX7 377 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01549A6NIU2 74 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 GAS8-AS1O95177 125 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 S100A6P06703 90 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 PCP4P48539 62 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM18Q96B42 140 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 A0A096LPF7 62 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2L6O14933 153 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 HSBP1O75506 76 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 AMTP48728 403 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LAGE3Q14657 143 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 IQCJQ1A5X6 159 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00614P0C842 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 CCL18P55774 89 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM243Q9BU79 118 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 C3orf84H3BNL1 204 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 TSHBP01222 138 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LELP1Q5T871 98 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01546A6NGU7 62 aa6.71□□□□□ -1.34
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