RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481116.5

ABCF3-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

TSL 4

Gene ABCF3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-215ENST00000481116 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.45□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.45□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 ISOC2Q96AB3 205 aa8.45□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM243Q9BU79 118 aa8.45□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 V9GYV3 84 aa8.45□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 HLA-DQA1P01909 254 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 COTL1Q14019 142 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 PEA15Q15121 130 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 ADIRFQ15847 76 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 BORCS7Q96B45 105 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 PRR34Q9NV39 138 aa8.44□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.43□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 A0A1B0GUT8 65 aa8.43□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 AMTP48728 403 aa8.43□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 MIAQ16674 131 aa8.43□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 EPM2AB3EWF7 344 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 UBE2L6O14933 153 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 REG3AQ06141 175 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 NUP35Q8NFH5 326 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 FRZBQ92765 325 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 RNF185Q96GF1 192 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 NAT8Q9UHE5 227 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 FAT1Q14517 4588 aa8.42□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 FAM231BA6NCW3 169 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 USP17L23D6RBM5 183 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 RAB14P61106 215 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 AMN1Q8IY45 258 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.41□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 A0A1B0GUV1 79 aa8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 SMKR1H3BMG3 65 aa8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 RAB4AP20338 218 aa8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 Q5VSD8 79 aa8.4□□□□□ -1.06
ABCF3-215ENST00000481116 NCR2O95944 276 aa8.39□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 PMCHP20382 165 aa8.39□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 RIGQ13278 110 aa8.39□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 APCSP02743 223 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 PRSS1P07477 247 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 CLLU1Q5K131 121 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 ST20Q9HBF5 79 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.38□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 I3L3M4 83 aa8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 TSHBP01222 138 aa8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 C14orf177Q52M58 125 aa8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 Q6ZSA8 131 aa8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.37□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 FGF6P10767 208 aa8.36□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 CAMPP49913 170 aa8.36□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 IFITM2Q01629 132 aa8.36□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.36□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 MRAP2Q96G30 205 aa8.36□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 ESDP10768 282 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 SCXQ7RTU7 201 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 NRACQ8N912 160 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCF3-215ENST00000481116 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.33□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 FAM229AH3BQW9 127 aa8.33□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 H7C423 109 aa8.33□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.32□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 hDV102S1A0JD36 115 aa8.32□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 SLPIP03973 132 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 A0A1B0GXF2 115 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 VCYO14598 125 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 CKS2P33552 79 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 HBBP68871 147 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 UQCC3Q6UW78 93 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 C15orf56Q8N910 161 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM101Q96IK0 257 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 BTF3L4Q96K17 158 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCF3-215ENST00000481116 A0A1B0GW15 77 aa8.29□□□□□ -1.08
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