RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GUT8 65 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 RBX1P62877 108 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 BAALCQ8WXS3 180 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM243Q9BU79 118 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 NAT8Q9UHE5 227 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 COTL1Q14019 142 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 ADIRFQ15847 76 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR34Q9NV39 138 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 MIAQ16674 131 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GUV1 79 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 AMTP48728 403 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 XGP55808 180 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2L6O14933 153 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 RIGQ13278 110 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP35Q8NFH5 326 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 NCR2O95944 276 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF185Q96GF1 192 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB4AP20338 218 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 REG3AQ06141 175 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 AMN1Q8IY45 258 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 MRAP2Q96G30 205 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 GAS8-AS1O95177 125 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 HLA-DQA1P01909 254 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 APCSP02743 223 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB14P61106 215 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 C14orf177Q52M58 125 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 Q5VSD8 79 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 ST20Q9HBF5 79 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 I3L3M4 83 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 USP17L23D6RBM5 183 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 H7C423 109 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 PMCHP20382 165 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GW15 77 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 HAMPP81172 84 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 Q6ZSA8 131 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R17O96001 155 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 TSHBP01222 138 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 SMKR1H3BMG3 65 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 FGF6P10767 208 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 ESDP10768 282 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 CAMPP49913 170 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC01620Q4KN68 170 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 CLLU1Q5K131 121 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 NRACQ8N912 160 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 S100A8P05109 93 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 HBBP68871 147 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GXF2 115 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R2P9O14990 202 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 PRSS1P07477 247 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00862A6NCI5 91 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 F8W036 122 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 VCYO14598 125 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 BTF3L4Q96K17 158 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 CKS2P33552 79 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM101Q96IK0 257 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.17□□□□□ -0.94
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