RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 FAM231CP0DMU5 169 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD1-202ENST00000375175 ATXN8Q156A1 80 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD1-202ENST00000375175 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
TMOD1-202ENST00000375175 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.71□□□□□ -0.85
TMOD1-202ENST00000375175 H3BMM0 161 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 J3QLI3 93 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2WQ96B02 151 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0B4J2C4 111 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 KNCNA6PVL3 124 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 TRIAP1O43715 76 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF702PQ9H963 129 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 RHOHQ15669 191 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB136Q30KP8 78 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 A0A096LNT2 108 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 I3L3M4 83 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 SLURP1P55000 103 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 Q6YL49 198 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB131AP59861 70 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 CACNA1AO00555 2505 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 C2orf82Q6UX34 121 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 POLQO75417 2590 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 CREBBPQ92793 2442 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 LEPROTO15243 131 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01600Q96MT4 127 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 ZANQ9Y493 2812 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM223A0PJW6 202 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 H7C423 109 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 PRB1P04280 392 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 PRM2P04554 102 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 DUX3Q96PT4 197 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 PROK1P58294 105 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 ACACBO00763 2458 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0J9YXV3 536 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01587Q99440 93 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 M0R2P5 195 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZSV7 163 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 RNF152Q8N8N0 203 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 CLEC2BQ92478 149 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 CENPEQ02224 2701 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 FSHBP01225 129 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0J9YXY3 114 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 CD28P10747 220 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 PEMTQ9UBM1 199 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 SPXQ9BT56 116 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS2P07478 247 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP10-9P60411 292 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 H3BT86 120 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 NPC2P61916 151 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 LITAFQ99732 161 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM126AQ9H061 195 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF415Q09FC8 603 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 Q9UF83 564 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-202ENST00000375175 FBN2P35556 2912 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.2 ms