RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 MBP02144 154 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 ENKURQ8TC29 256 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 COX6A2Q02221 97 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 MAJINQ3KP22 176 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 ATP6V0CP27449 155 aa11.31□□□□□ -0.6
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UBE2C-208ENST00000617055 F5H697 171 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2G2P60604 165 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 IQCJQ1A5X6 159 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 SSNA1O43805 119 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 GZMBP10144 247 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 SERF2P84101 59 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 STPG4Q8N801 248 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 FMC1Q96HJ9 113 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2C-208ENST00000617055 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2G1P62253 170 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 A6NHS1 94 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 FAM74A7A6NL05 159 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 C15orf56Q8N910 161 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 A0A1B0GUV1 79 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 LTAP01374 205 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 CFAP161Q6P656 301 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF726P1Q15940 193 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 AQP10Q96PS8 301 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 MUC2Q02817 5179 aa11.23□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.23□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM243Q9BU79 118 aa11.23□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.22□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 SNAI2O43623 268 aa11.22□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 CXCL1P09341 107 aa11.22□□□□□ -0.61
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UBE2C-208ENST00000617055 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.22□□□□□ -0.61
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UBE2C-208ENST00000617055 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.21□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 SULT1A2P50226 295 aa11.21□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 SSTP61278 116 aa11.21□□□□□ -0.61
UBE2C-208ENST00000617055 OR5AL1P0C617 328 aa11.2□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZRP5 223 aa11.2□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 AP1S3Q96PC3 154 aa11.2□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 M0QY20 66 aa11.19□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.19□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 H7C1H1 209 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 UPK1BO75841 260 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 AKR1C3P42330 323 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 S100ZQ8WXG8 99 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2L6O14933 153 aa11.17□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 MGPP08493 103 aa11.17□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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UBE2C-208ENST00000617055 CST9LP1Q5W188 147 aa11.16□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.16□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 STOML3Q8TAV4 291 aa11.16□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 FAM231BA6NCW3 169 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 FHITP49789 147 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2C-208ENST00000617055 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.15□□□□□ -0.62
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UBE2C-208ENST00000617055 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 FAT4Q6V0I7 4981 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 AMTP48728 403 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 MLST8Q9BVC4 326 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 RASL11AQ6T310 242 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2C-208ENST00000617055 BAGE2Q86Y30 109 aa11.11□□□□□ -0.63
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