RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 NCR2O95944 276 aa8.73□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 GYPEP15421 78 aa8.73□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.73□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 NRACQ8N912 160 aa8.73□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.73□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 F5H697 171 aa8.72□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 MRAP2Q96G30 205 aa8.72□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
DNMT1-208ENST00000586667 UBE2D3P61077 147 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 UBE2D2P62837 147 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 FRZBQ92765 325 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.71□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 GAGE12JA6NER3 117 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 COLCA2A8K830 154 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 HLA-DQA1P01909 254 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 GAGE1Q13065 139 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 GAGE4Q13068 117 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 GAGE5Q13069 117 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 GAGE13Q4V321 117 aa8.7□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.69□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.69□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 D6R8Y8 96 aa8.69□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 H7C1H1 209 aa8.69□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 NUDT3O95989 172 aa8.69□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TCTAP57738 103 aa8.69□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 NPYP01303 97 aa8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 MT-ND6P03923 174 aa8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 SRIP30626 198 aa8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 COX19Q49B96 90 aa8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 NIT2Q9NQR4 276 aa8.68□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 PHOX2AO14813 284 aa8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 ORMDL3Q8N138 153 aa8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 RYR2Q92736 4967 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 KMT2AQ03164 3969 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 APCSP02743 223 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 PPBPP02775 128 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 CKS2P33552 79 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TIRAPP58753 221 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 ESRGQ1W209 222 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.66□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TNFRSF6BO95407 300 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 RAB5AP20339 215 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 PRELID3AQ96N28 172 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.65□□□□□ -1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.64□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.64□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.64□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.64□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 TSHBP01222 138 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 C20orf78Q9BR46 151 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 ST20Q9HBF5 79 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.63□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 PPP1R17O96001 155 aa8.62□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.62□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 UPK3BQ9BT76 320 aa8.62□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 DNAH2Q9P225 4427 aa8.62□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 PRSS47A8MTI9 375 aa8.61□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 LELP1Q5T871 98 aa8.61□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.61□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.6□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 TRGC2P03986 189 aa8.6□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 IQCJQ1A5X6 159 aa8.6□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.6□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 Q8N3U1 123 aa8.6□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 I3L3M4 83 aa8.59□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 CCL18P55774 89 aa8.59□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.59□□□□□ -1.03
DNMT1-208ENST00000586667 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.59□□□□□ -1.03
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