RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A1B0GV50	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		M0R381	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	CTRL	P40313	264 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FRZB	Q92765	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	JPT2	Q9H910	190 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		Q9UF83	564 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A087WTM6	91 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		P01737	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	CACNG7	P62955	275 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	CT83	Q5H943	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A087WWL8	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		K7EN84	100 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		M0QY20	66 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	PKIA	P61925	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GAGE1	Q13065	139 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GAGE4	Q13068	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GAGE5	Q13069	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	NIT1	Q86X76	327 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A1B0GVG6	124 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		H7C1H1	209 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	ELOB	Q15370	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	NTF3	P20783	257 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		Q8N814	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A1B0GUV1	79 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A8MWL6	223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	GZMB	P10144	247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		Q0VG73	95 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF56	Q15929	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	RMI2	Q96E14	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	FAT1	Q14517	4588 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A087WX48	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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