RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, human

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC6-208	ENST00000478914	XKRY2	A2RUG3	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	WFDC2	Q14508	124 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	CENPW	Q5EE01	88 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	C11orf52	Q96A22	123 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	TPPP3	Q9BW30	176 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.78	□□□□□ -1.48
XRCC6-208	ENST00000478914		H7C1H1	209 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	PDE6D	O43924	150 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	MGP	P08493	103 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	GNG4	P50150	75 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	CCL20	P78556	96 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	SMIM12	Q96EX1	92 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	BIN3	Q9NQY0	253 aa		5.77	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914		P01737	135 aa		5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	SULT1A2	P50226	295 aa		5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	CACNG7	P62955	275 aa		5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	MED9	Q9NWA0	146 aa		5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.76	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	RAB19	A4D1S5	217 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914		F2Z2F3	143 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	TRGC1	P0CF51	173 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	GZMB	P10144	247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	MPV17L2	Q567V2	206 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	ATRAID	Q6UW56	229 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC51B	Q86UW2	128 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	VAX2	Q9UIW0	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	IGLV2-8	P01709	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	IGLC6	P0CF74	106 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	BCL2	P10415	239 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	MIA	Q16674	131 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914		Q6ZSA8	131 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	GAGE6	Q13070	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		5.73	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914		M0QY20	66 aa		5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	RBX1	P62877	108 aa		5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		5.72	□□□□□ -1.49
XRCC6-208	ENST00000478914	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	UBE2L6	O14933	153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	NTF3	P20783	257 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	NIT2	Q9NQR4	276 aa		5.71	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914		J3QL48	77 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	CTRL	P40313	264 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	REG3A	Q06141	175 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	COTL1	Q14019	142 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	TWIST1	Q15672	202 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	FAT1	Q14517	4588 aa		5.7	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	AMT	P48728	403 aa		5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
XRCC6-208	ENST00000478914	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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