RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf118A6NHY6 69 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 E9PLD3 99 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TSHBP01222 138 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 ACANP16112 2415 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 KNCNA6PVL3 124 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 F5H697 171 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 K7EP13 123 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 PMVKQ15126 192 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 VAMP3Q15836 100 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF876PQ49A33 203 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF56Q15929 161 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 A8MWV9 139 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF415Q09FC8 603 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 M0R2P5 195 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 SCGB2A2Q13296 93 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 I3L3M4 83 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CEND1Q8N111 149 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 RAX2Q96IS3 184 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 OR11H12B2RN74 326 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 OR11H2Q8NH07 326 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 SPXQ9BT56 116 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CST9LQ9H4G1 147 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 TCTAP57738 103 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 ESM1Q9NQ30 184 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 ZANQ9Y493 2812 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 INSP01308 110 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CRYBA4P53673 196 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf86A6NJI1 115 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM13P0DJ93 91 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 NFE4Q86UQ8 179 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 RHODO00212 210 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 DUX3Q96PT4 197 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 HERVK_113P61574 105 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 CCL24O00175 119 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 P0DMU3 169 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 FAM231AP0DMU4 169 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 FAM231CP0DMU5 169 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 IL17DQ8TAD2 202 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 FXYD2P54710 66 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRF-212ENST00000477970 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRF-212ENST00000477970 GCSHP23434 173 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 K7EP34 96 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRF-212ENST00000477970 GAGE10A6NGK3 116 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 H3BUT2 72 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-53P01767 116 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01587Q99440 93 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 AMELXQ99217 191 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRF-212ENST00000477970 HILS1P60008 231 aa8.86□□□□□ -0.99
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