RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	ELOB	Q15370	118 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	RMI2	Q96E14	147 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM262	E9PQX1	116 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	HAMP	P81172	84 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817		P01737	135 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		Q5VSD8	79 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	ATRAID	Q6UW56	229 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	FRZB	Q92765	325 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	CACNG7	P62955	275 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		F2Z2F3	143 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		M0QY20	66 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		Q0VG73	95 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	MGP	P08493	103 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	ENHO	Q6UWT2	76 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		Q8N976	141 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		H7C1H1	209 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	NTF3	P20783	257 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	PKIA	P61925	76 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817	OCC1	Q8TAD7	63 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP2-208	ENST00000476817		K7EN84	100 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	CRP	P02741	224 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817		Q6ZSA8	131 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM229A	H3BQW9	127 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	CTRL	P40313	264 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	GAGE6	Q13070	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	LINC01620	Q4KN68	170 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	RBX1	P62877	108 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM250	H0YL14	139 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	TWIST1	Q15672	202 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	MIA	Q16674	131 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CTBP2-208	ENST00000476817	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM243	Q9BU79	118 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	USP17L23	D6RBM5	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	GATD1	Q8NB37	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A1B0GUV1	79 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	CEBPG	P53567	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	REG3A	Q06141	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	SCX	Q7RTU7	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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