RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 COX8AP10176 69 aa15.62■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 CITED1Q99966 193 aa15.62■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A087WX48 190 aa15.61■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 INSL3P51460 131 aa15.61■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.61■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.61■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 NEGR1Q7Z3B1 354 aa15.6■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.6■□□□□ 0.09
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SNRNP25-201ENST00000293861 RIPPLY3P57055 190 aa15.6■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 ERASQ7Z444 233 aa15.6■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 IL17DQ8TAD2 202 aa15.6■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 CYSLTR1Q9Y271 337 aa15.6■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 DPM2O94777 84 aa15.59■□□□□ 0.09
SNRNP25-201ENST00000293861 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.59■□□□□ 0.09
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SNRNP25-201ENST00000293861 AZU1P20160 251 aa15.58■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.58■□□□□ 0.08
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SNRNP25-201ENST00000293861 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.57■□□□□ 0.08
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SNRNP25-201ENST00000293861 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.56■□□□□ 0.08
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SNRNP25-201ENST00000293861 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa15.56■□□□□ 0.08
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SNRNP25-201ENST00000293861 I3L3M4 83 aa15.55■□□□□ 0.08
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SNRNP25-201ENST00000293861 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa15.55■□□□□ 0.08
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SNRNP25-201ENST00000293861 DLEU1O43261 78 aa15.54■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 BOD1L2Q8IYS8 172 aa15.54■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 TIMM17AQ99595 171 aa15.54■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.53■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM141Q96I45 108 aa15.53■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa15.53■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 TSHBP01222 138 aa15.53■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 IGHV3-53P01767 116 aa15.53■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SNRNP25-201ENST00000293861 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 BATFQ16520 125 aa15.51■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.51■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.51■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.51■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.51■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.51■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.5■□□□□ 0.07
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SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.5■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 P0DMU3 169 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM231AP0DMU4 169 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM231CP0DMU5 169 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 Q6ZSN1 163 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 SIVA1O15304 175 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 C16orf74Q96GX8 76 aa15.49■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA3Q8NHX4 192 aa15.48■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 JMJD1CQ15652 2540 aa15.48■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 NMUP48645 174 aa15.47■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa15.47■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.47■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 C12orf54Q6X4T0 127 aa15.47■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.46■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 PMVKQ15126 192 aa15.46■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 MPV17L2Q567V2 206 aa15.46■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 PCP2Q8IVA1 136 aa15.46■□□□□ 0.07
SNRNP25-201ENST00000293861 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 OR4C5Q8NGB2 326 aa15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 TCTAP57738 103 aa15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAV4A0A0B4J268 109 aa15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 Q6ZTI0 123 aa15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 OVOL2Q9BRP0 275 aa15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 CST9LQ9H4G1 147 aa15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 RRN3P1Q2M238 152 aa15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 Q9UF83 564 aa15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 TENM1Q9UKZ4 2725 aa15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 WIPF1O43516 503 aa15.41■□□□□ 0.06
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