RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	FMC1	Q96HJ9	113 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RS1	O15537	224 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	GCG	P01275	180 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	LAGE3	Q14657	143 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RHOH	Q15669	191 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF876P	Q49A33	203 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RAB19	A4D1S5	217 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	TEX46	H3BTG2	121 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468		K7EQM0	130 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SMUG1	Q53HV7	270 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	LELP1	Q5T871	98 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	PTH2	Q96A98	100 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf85	Q96MD7	179 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	VAX2	Q9UIW0	290 aa		9.26	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	AKR1C3	P42330	323 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZSA8	131 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	COMMD7	Q86VX2	200 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468		Q9HAA7	133 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		9.24	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468		C9JQL5	133 aa		9.24	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		9.24	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	PDE6D	O43924	150 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SH2D1A	O60880	128 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-30	P01768	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-33	P01772	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00694	P0DN24	101 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2G1	P62253	170 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	WFDC2	Q14508	124 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	BAGE2	Q86Y30	109 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	TM2D2	Q9BX73	214 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MUC1-222	ENST00000610468	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM250	H0YL14	139 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	IFNA1	P01562	189 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01559	Q495D7	138 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	CENPW	Q5EE01	88 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N3U1	123 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		K7EN84	100 aa		9.2	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	TOR2A	Q5JU69	321 aa		9.2	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	PARL	Q9H300	379 aa		9.2	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		9.19	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		9.19	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		9.19	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		A8MWV9	139 aa		9.18	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	OCC1	Q8TAD7	63 aa		9.18	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM12	Q96EX1	92 aa		9.18	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		J3QL48	77 aa		9.17	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		Q9UF83	564 aa		9.17	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		A0A087WWC5	75 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE12J	A6NER3	117 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	CXCL1	P09341	107 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE1	Q13065	139 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE4	Q13068	117 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE5	Q13069	117 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE13	Q4V321	117 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	IL36B	Q9NZH7	164 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	COX11	Q9Y6N1	276 aa		9.16	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		9.15	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		B4DEV8	164 aa		9.15	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468		M0R036	132 aa		9.15	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	LECT2	O14960	151 aa		9.15	□□□□□ -0.94
MUC1-222	ENST00000610468	GNG4	P50150	75 aa		9.15	□□□□□ -0.94

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