RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	PANO1	I0J062	215 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	S100A10	P60903	97 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932	THAP6	Q8TBB0	222 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A087WX48	190 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR7C2	O60412	319 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRSS1	P07477	247 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRSS2	P07478	247 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PGP	A6NDG6	321 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLA2G10	O15496	165 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	IL7	P13232	177 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	GAGE1	Q13065	139 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	GAGE4	Q13068	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	GAGE5	Q13069	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	ASB13	Q8WXK3	278 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A087WYN8	130 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932		F6UZH7	168 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	LYRM1	O43325	122 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	TCRB	P04435	133 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	KHDC3L	Q587J8	217 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	OTOR	Q9NRC9	128 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932		A8MWV9	139 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PHOX2A	O14813	284 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	CRP	P02741	224 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PARL	Q9H300	379 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	NUDT15	Q9NV35	164 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC160	A6NGH7	325 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	AMT	P48728	403 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	MIA	Q16674	131 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	TAS2R45	P59539	299 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	NMES1	Q9C002	83 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	MBD2	Q9UBB5	411 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q9UF83	564 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	TAAR5	O14804	337 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	PKIA	P61925	76 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	GNG5	P63218	68 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	SGK494	Q96LW2	274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	SIX6	O95475	246 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	GCG	P01275	180 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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