RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 SYT8Q8NBV8 401 aa13.28□□□□□ -0.28
MFGE8-208ENST00000558773 SFRP2Q96HF1 295 aa13.28□□□□□ -0.28
MFGE8-208ENST00000558773 FMC1Q96HJ9 113 aa13.28□□□□□ -0.28
MFGE8-208ENST00000558773 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.27□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 FHITP49789 147 aa13.27□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.27□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.27□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.27□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 LTAP01374 205 aa13.26□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 TOR2AQ5JU69 321 aa13.26□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.26□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 UBE2G1P62253 170 aa13.25□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 LINC01559Q495D7 138 aa13.25□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 ARPC5O15511 151 aa13.24□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.24□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 Q6ZSA8 131 aa13.24□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 NIT1Q86X76 327 aa13.24□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.24□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 A0A087WWL8 130 aa13.23□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 STOML3Q8TAV4 291 aa13.23□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 COX11Q9Y6N1 276 aa13.23□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.22□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 CST9LP1Q5W188 147 aa13.22□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.21□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 M0R381 172 aa13.21□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 LECT2O14960 151 aa13.21□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 ZFP82Q8N141 532 aa13.21□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 BAALCQ8WXS3 180 aa13.21□□□□□ -0.29
MFGE8-208ENST00000558773 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.2□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.2□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.2□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 PAGE4O60829 102 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 SEC11BP0C7V7 166 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 AKR1C3P42330 323 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 UBE2D3P61077 147 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 UBE2D2P62837 147 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 RGS21Q2M5E4 152 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 RMI2Q96E14 147 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.19□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 MLST8Q9BVC4 326 aa13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 KLK12Q9UKR0 248 aa13.18□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 SMLR1H3BR10 107 aa13.17□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 CXCL1P09341 107 aa13.17□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF345Q14585 488 aa13.17□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.17□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 Q8N976 141 aa13.17□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 ELOBQ15370 118 aa13.16□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.16□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.15□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 A0A087WX48 190 aa13.15□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 UMAD1C9J7I0 102 aa13.15□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 RAB4BP61018 213 aa13.15□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 PRR27Q6MZM9 219 aa13.15□□□□□ -0.3
MFGE8-208ENST00000558773 SNAI2O43623 268 aa13.14□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.14□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.14□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 UBE2WQ96B02 151 aa13.14□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 HMSDA8MTL9 139 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 LINC01620Q4KN68 170 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 BAGE2Q86Y30 109 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 Q0VG73 95 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 OR5AL1P0C617 328 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 ENHOQ6UWT2 76 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 A0A0D9SG52 128 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 A0A1B0GV50 99 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 PFDN1O60925 122 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 TMUB2Q71RG4 321 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 SCXQ7RTU7 201 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM262E9PQX1 116 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 BCL2L11O43521 198 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF56Q15929 161 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-208ENST00000558773 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-208ENST00000558773 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-208ENST00000558773 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-208ENST00000558773 MPV17L2Q567V2 206 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-208ENST00000558773 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-208ENST00000558773 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-208ENST00000558773 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms