RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXCL1P09341 107 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7EQD1 137 aa13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFITM2Q01629 132 aa13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHOHQ15669 191 aa13.21□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.2□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.2□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.2□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.2□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHODO00212 210 aa13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR27Q6MZM9 219 aa13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OCC1Q8TAD7 63 aa13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BIN3Q9NQY0 253 aa13.19□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9JQL5 133 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7EN84 100 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7EP13 123 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP82Q8N141 532 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.18□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa13.17□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XGP55808 180 aa13.17□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.17□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A087WTM6 91 aa13.16□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R381 172 aa13.15□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLLU1Q5K131 121 aa13.15□□□□□ -0.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNAI2O43623 268 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EVI2AP22794 236 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIRAPP58753 221 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.14□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XKRY2A2RUG3 117 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5AL1P0C617 328 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEA15Q15121 130 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT11Q96G61 164 aa13.13□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLC6P0CF74 106 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEBPGP53567 150 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP10-1P60331 282 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB14P61106 215 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFRP2Q96HF1 295 aa13.12□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF727A8MUV8 499 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 P01737 135 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01551Q86U37 167 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRZBQ92765 325 aa13.11□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.1□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.1□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.1□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A087WWL8 130 aa13.09□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GZMBP10144 247 aa13.09□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q5VSD8 79 aa13.09□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.09□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JPT2Q9H910 190 aa13.09□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRYGDP07320 174 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM17P0DL12 118 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCSHP23434 173 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYCBP2O75592 4640 aa13.08□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE12JA6NER3 117 aa13.07□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE1Q13065 139 aa13.07□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE4Q13068 117 aa13.07□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE5Q13069 117 aa13.07□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE13Q4V321 117 aa13.07□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPPP3Q9BW30 176 aa13.07□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM241Q24JQ0 296 aa13.06□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LELP1Q5T871 98 aa13.06□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.06□□□□□ -0.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AP1S3Q96PC3 154 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.3 ms