RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 REG3AQ06141 175 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 CTSZQ9UBR2 303 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 SDK2Q58EX2 2172 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV2-14P01704 120 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 U3KQA8 63 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 UBALD1Q8TB05 177 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf52Q96A22 123 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS13CQ709C8 3753 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-16P04430 117 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZSV7 163 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 LYRM9A8MSI8 78 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRYO14603 147 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 F8WEM9 126 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 RMI2Q96E14 147 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 HBDP02042 147 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 BSNQ9UPA5 3926 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZVQ6 151 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF329Q86UD4 541 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 PATE3B3GLJ2 98 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 ACYP1P07311 99 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0B4J2C4 111 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 PSPHP1O15172 72 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 GHRHP01286 108 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-1P01715 115 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 MED14OSP0DP75 135 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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RABGEF1-202ENST00000380828 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 LCA10Q71F78 164 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 GPHB5Q86YW7 130 aa5.02□□□□□ -1.61
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
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RABGEF1-202ENST00000380828 PINLYPA6NC86 204 aa5.01□□□□□ -1.61
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-9P01782 118 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 H0YGG7 62 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.01□□□□□ -1.61
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