RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CDS2O95674 445 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IFNA21P01568 189 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1-17P01599 117 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV2D-28P01615 120 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IL5P05113 134 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 RD3LP0DJH9 198 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 M6PRP20645 277 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 GALR1P47211 349 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TP53RKQ96S44 253 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 MED9Q9NWA0 146 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 LYSTQ99698 3801 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00862A6NCI5 91 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 KNCNA6PVL3 124 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 H3BMM0 161 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CD3DP04234 171 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TCRBP04435 133 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 FABP1P07148 127 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IGLC1P0CG04 106 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 OR10J1P30954 320 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 C12orf74Q32Q52 190 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SP6Q3SY56 376 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 COX19Q49B96 90 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 Q5BKY6 102 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SPINK9Q5DT21 86 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 PSMG4Q5JS54 123 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 U3KQ87 197 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 DISC1C4P0D8 188 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFB6O95139 128 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IFNA10P01566 189 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IL4P05112 153 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 OR5AC1P0C628 307 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 HLA-DRB4P13762 266 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 S100A7P31151 101 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 INPP1P49441 399 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 PSMB2P49721 201 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 PSG3Q16557 428 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 NMSQ5H8A3 153 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 GPR146Q96CH1 333 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 PRRT1Q99946 306 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 MED28Q9H204 178 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 NAA60Q9H7X0 242 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 HMSDA8MTL9 139 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 G3V3Q6 166 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 K7EN84 100 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 ISLRO14498 428 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 IFNA7P01567 189 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 PSMB3P49720 205 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 B2MP61769 119 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CTAG1AP78358 180 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TTC32Q5I0X7 151 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CLLU1Q5K131 121 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 TEX261Q6UWH6 196 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 ACY3Q96HD9 319 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 C18orf15Q96N68 181 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-208ENST00000560725 RTL8CO15255 209 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.1 ms