RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGLV2-8P01709 118 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 ZNF876PQ49A33 203 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TM2D2Q9BX73 214 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 MBP02144 154 aa7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 ODF1Q14990 250 aa7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 Q5BKY6 102 aa7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 LELP1Q5T871 98 aa7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 Q8N3U1 123 aa7.29□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-30P01768 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-33P01772 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 LAGE3Q14657 143 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 SMUG1Q53HV7 270 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TOR2AQ5JU69 321 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 BAALCQ8WXS3 180 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 MED28Q9H204 178 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.28□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 GCGP01275 180 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 TCRAP04437 139 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 SEC11BP0C7V7 166 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RAB2AP61019 212 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GNG5P63218 68 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 PTH2Q96A98 100 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 AQP10Q96PS8 301 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 PSG8Q9UQ74 426 aa7.27□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RNF222A6NCQ9 220 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 A8MWV9 139 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 IGLV2-11P01706 119 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 STAG3L2P0CL84 134 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 STAG3L3P0CL85 134 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 SERF2P84101 59 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 TVP23CQ96ET8 276 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 COX11Q9Y6N1 276 aa7.26□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 A0A087WWC5 75 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GAS8-AS1O95177 125 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 CXorf1O96002 111 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ATP6V0CP27449 155 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 PRNTQ86SH4 94 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 SUN5Q8TC36 379 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RMI2Q96E14 147 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 SGK494Q96LW2 274 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 C9orf85Q96MD7 179 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 LPAP08519 4548 aa7.25□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GGTLC3B5MD39 225 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GCHFRP30047 84 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZRU5 148 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RAB24Q969Q5 203 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 EPDR1Q9UM22 224 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.24□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.23□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 G3V3Q6 166 aa7.23□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RHODO00212 210 aa7.23□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.23□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.23□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 A0A1W2PRE2 83 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GAGE12JA6NER3 117 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GAGE1Q13065 139 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GAGE4Q13068 117 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GAGE5Q13069 117 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 GAGE13Q4V321 117 aa7.22□□□□□ -1.25
RNF4-218ENST00000513284 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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