RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-212ENST00000484841 IGLV2-11P01706 119 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-30P01768 117 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-33P01772 117 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 LELP1Q5T871 98 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 Q9HAA7 133 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 A8MWV9 139 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 ASIPP42127 132 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP10-1P60331 282 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 UBE2G2P60604 165 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 XGP55808 180 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 Q5BKY6 102 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 LINC00479Q96M42 142 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 PEX7O00628 323 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 SYT8Q8NBV8 401 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 TM2D2Q9BX73 214 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 PARLQ9H300 379 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-212ENST00000484841 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 GAGE12JA6NER3 117 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 B4DEV8 164 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 GAGE1Q13065 139 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 GAGE4Q13068 117 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 GAGE5Q13069 117 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 GAGE13Q4V321 117 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 Q5VSD8 79 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 RNF222A6NCQ9 220 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 LAGE3Q14657 143 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 IL36BQ9NZH7 164 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 UBE2G1P62253 170 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 ZNF726P1Q15940 193 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 TOR2AQ5JU69 321 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 Q86TA4 180 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 Q8N814 137 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WWC5 75 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM74A7A6NL05 159 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM229AH3BQW9 127 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 H3BVH4 76 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 RHODO00212 210 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 STOML3Q8TAV4 291 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 M0R036 132 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.48□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZSN1 163 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 FMC1Q96HJ9 113 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.47□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 ARPC5O15511 151 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 CST9LP1Q5W188 147 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-212ENST00000484841 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 SH2D1AO60880 128 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 SEC11BP0C7V7 166 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 JPT2Q9H910 190 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 DNLZQ5SXM8 178 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 RMI2Q96E14 147 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 COX11Q9Y6N1 276 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 M0R381 172 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTB-212ENST00000484841 AKR1C3P42330 323 aa13.43□□□□□ -0.26
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