RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.5□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.5□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf33Q8WU49 177 aa10.5□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MITD1Q8WV92 249 aa10.5□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.5□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP10-8P60410 259 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR73Q6P4I2 378 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENHOQ6UWT2 76 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf1Q9H5F2 150 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q9UF83 564 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.49□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.48□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAAR5O14804 337 aa10.48□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TVP23CQ96ET8 276 aa10.48□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.48□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTORQ9NRC9 128 aa10.48□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WYN8 130 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGSF23A1L1A6 192 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHOX2AO14813 284 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM18P0DKX4 95 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.47□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM262E9PQX1 116 aa10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIAQ16674 131 aa10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 REG3GQ6UW15 175 aa10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.46□□□□□ -0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM25EA8MYX2 175 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCSO14618 274 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KHDC3LQ587J8 217 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THAP6Q8TBB0 222 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 V9GYH0 126 aa10.45□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.44□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0U1RQV1 116 aa10.44□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHODO00212 210 aa10.44□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R45P59539 299 aa10.44□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.44□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A10P60903 97 aa10.43□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.43□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.43□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.43□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GCGP01275 180 aa10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMBIM6P55061 237 aa10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKIAP61925 76 aa10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBD2Q9UBB5 411 aa10.42□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNPY1Q3B7I2 92 aa10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP69Q49AA0 526 aa10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.4□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPV17L2Q567V2 206 aa10.4□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.4□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JPT2Q9H910 190 aa10.4□□□□□ -0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHTF8P0CG12 524 aa10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A5P33763 92 aa10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMUG1Q53HV7 270 aa10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTSF1Q8WW33 167 aa10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.39□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hDV102S1A0JD36 115 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPXA8MT69 81 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2D3P61077 147 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2D2P62837 147 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB32Q13637 225 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGK494Q96LW2 274 aa10.38□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7EQM0 130 aa10.37□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNG5P63218 68 aa10.37□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NHLH2Q02577 135 aa10.37□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIQKQ629K1 86 aa10.37□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.37□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR34Q9NV39 138 aa10.37□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL36BQ9NZH7 164 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms