RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.97□□□□□ -0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CST7O76096 145 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF876PQ49A33 203 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PYDC2Q56P42 97 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C2orf50Q96LR7 162 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.96□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0D9SG52 128 aa9.95□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TYMSP04818 313 aa9.95□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.95□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM63Q969Q1 353 aa9.95□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNS1Q96KK3 526 aa9.95□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A087WWC5 75 aa9.94□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.94□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FGF7P21781 194 aa9.94□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBE2WQ96B02 151 aa9.94□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLK12Q9UKR0 248 aa9.94□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAGE12JA6NER3 117 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DIRC3C9JPN6 131 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RANP62826 216 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAGE1Q13065 139 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAGE4Q13068 117 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAGE5Q13069 117 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAGE13Q4V321 117 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 S100A11P31949 105 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INPP1P49441 399 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASB13Q8WXK3 278 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ELOBQ15370 118 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FXYD5Q96DB9 178 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.91□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A087WX48 190 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR7C2O60412 319 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GAS8-AS1O95177 125 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HBG1P69891 147 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HBG2P69892 147 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 Q0VG73 95 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NIT1Q86X76 327 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STX12Q86Y82 276 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMED6Q8WW62 240 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 F6UZH7 168 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SULT1A1P50225 295 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HYLS1Q96M11 299 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNXBP22105 4242 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM25EA8MYX2 175 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDUFB6O95139 128 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP6V1FQ16864 119 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NMES1Q9C002 83 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TREM1Q9NP99 234 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PGPA6NDG6 321 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCSO14618 274 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRPP02741 224 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMIM18P0DKX4 95 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LINC00694P0DN24 101 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MITD1Q8WV92 249 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPH3Q96FX2 82 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP17L23D6RBM5 183 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HLA-DQA1P01909 254 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGSF23A1L1A6 192 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 S100A10P60903 97 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 THAP6Q8TBB0 222 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTH2Q96A98 100 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms