RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 PPT1P50897 306 aa11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 RHOBP62745 196 aa11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 KIR3DS1Q14943 382 aa11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 MIC13Q5XKP0 118 aa11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.03□□□□□ -0.64
SPCS1-201ENST00000233025 APOC3P02656 99 aa11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 CDKN1BP46527 198 aa11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01587Q99440 93 aa11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SEC11CQ9BY50 192 aa11.02□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SFTA3P0C7M3 94 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF726P1Q15940 193 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 KHDC3LQ587J8 217 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 S100A7AQ86SG5 101 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 RAB24Q969Q5 203 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GNG13Q9P2W3 67 aa11.01□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 PRAC2D3DTV9 90 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 IGLC2P0DOY2 106 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 HTN1P15515 57 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 CCL20P78556 96 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF506Q5JVG8 444 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SVBPQ8N300 66 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 MANBALQ9NQG1 85 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 RNF24Q9Y225 148 aa11□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 H3BTX0 84 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 COX7A2P2O60397 106 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ASIPP42127 132 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 PFDN5Q99471 154 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00467Q9BRT7 94 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE12BA1L429 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 H3BQ15 152 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 H7BYZ3 331 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE7O76087 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SNAPINO95295 136 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf1O96002 111 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE12FP0CL80 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE12GP0CL81 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE12IP0CL82 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 MT1HL1P0DM35 61 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 BCL2P10415 239 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R45P59539 299 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N814 137 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 VAX2Q9UIW0 290 aa10.98□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.97□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.97□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 XP32Q5T750 250 aa10.97□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.97□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.97□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 K7EP13 123 aa10.96□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.96□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 SCXQ7RTU7 201 aa10.96□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 ODF3Q96PU9 254 aa10.96□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 FUT9Q9Y231 359 aa10.96□□□□□ -0.65
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 STAG3L2P0CL84 134 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 STAG3L3P0CL85 134 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 CT45A10P0DMU9 189 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 CEBPGP53567 150 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.95□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.94□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N3U1 123 aa10.94□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.94□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 C9JQL5 133 aa10.93□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.93□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 ADCYAP1P18509 176 aa10.93□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 SUN5Q8TC36 379 aa10.93□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 J3KRW8 73 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 M0R3E3 92 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 RS1O15537 224 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 PAGE4O60829 102 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF253O75346 499 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 GCHFRP30047 84 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.92□□□□□ -0.66
SPCS1-201ENST00000233025 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.3 ms