RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10447Q3UQ92 135 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbxw26Q8BI58 466 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem212Q8C6V3 187 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm4894Q8CA09 118 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam174bQ8K064 153 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr802Q8VGJ2 312 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scp2d1Q9DAH1 156 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnd2Q9QYM5 227 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrebbpP45481 2441 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arhgef17Q80U35 2057 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A630076J17RikJ3QQ32 107 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbms1Q91W59 403 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccl8Q9Z121 97 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rsg1A2A825 258 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21244J3QK38 227 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fut9O88819 359 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl27aP14115 148 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P18530 117 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10192Q3V0S1 108 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1qtnf9Q4ZJN1 333 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ParlQ5XJY4 377 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrygcQ61597 174 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Morn2Q6UL01 79 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pef1Q8BFY6 275 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stpg2Q8C8J0 561 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ythdf2Q91YT7 579 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zcchc10Q9CX48 178 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mlst8Q9DCJ1 326 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Csmd1Q923L3 3564 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H2-M5A7VMS3 348 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ApcsP12246 224 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf260Q62513 407 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr924Q7TRB8 308 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr917Q7TRC3 309 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr335-psQ7TRY6 312 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plppr2Q8VCY8 343 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab31Q921E2 194 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf151Q9CQ29 239 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mettl9Q9EPL4 318 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5093E9PZB3 174 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CideaO70302 217 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnfrsf17O88472 185 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P04212 136 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HexbP20060 536 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q3UUX7 111 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MiaQ61865 130 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc17a9Q8VCL5 447 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1440Q8VFV4 315 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr709-ps1A0A140T8J9 307 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P04943 107 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gnb1P62874 340 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhox10Q4TU83 196 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1382Q7TQT3 311 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dok5Q91ZM9 306 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stard4Q99JV5 224 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr961Q9EQ84 314 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr154Q9QY00 318 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr159Q9QZ19 319 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rgs11Q9Z2H1 443 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5129F6YHA9 99 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist1h2bmP10854 126 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prss44Q402U7 372 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist1h2bhQ64478 126 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist2h2bbQ64525 126 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb1b12A0A087WP21 93 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 F2rl2O08675 369 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01759 136 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ms4a13Q5FWC3 203 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adat3Q6PAT0 349 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zzef1Q5SSH7 2924 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr556E9Q549 324 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ctdsp1P58466 261 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Obp2aQ8K1H9 176 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wipf1Q8K1I7 493 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r222Q8R269 308 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lypd8Q9D7S0 255 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9D9C7 252 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28171A0A087WQ19 227 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1458A0A1L1SSD5 307 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1016A2ASV2 309 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Efnb3O35393 340 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab33bO35963 229 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mtnd6P03925 172 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TymsP07607 307 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv3-6P18531 116 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrps21P58059 87 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr859Q7TRF5 309 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Siglec12Q91Y57 467 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BlnkQ9QUN3 457 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sec16aA2AIX1 2377 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28372A0A087WNV0 220 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fcrl6A1YIY0 268 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.9 ms