RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	GIPC3	Q8TF64	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	SRR	Q9GZT4	340 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	F2R	P25116	425 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	TALDO1	P37837	337 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RBX1	P62877	108 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZNX1	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RBAKDN	A6NC62	111 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	SPINK1	P00995	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CD1A	P06126	327 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CXCL2	P19875	107 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGP	P57054	158 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	BLOC1S1	P78537	153 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED1	Q13445	227 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR9	Q5T870	116 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZS49	121 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5S	Q99766	215 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440		M0QXV9	152 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOD	O00212	210 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	NUPR1	O60356	82 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	PTTG1	O95997	202 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	LCN15	Q6UWW0	184 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	DTD1	Q8TEA8	209 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	RLN1	P04808	185 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ERCC8	Q13216	396 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC29A1	Q99808	456 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BRN7	92 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A20	O43772	301 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	APOM	O95445	188 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM107A	O95990	144 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	NMB	P08949	121 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	MAL	P21145	153 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPRE2	Q15555	327 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZVH6	145 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N377	158 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ERICH4	A6NGS2	130 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	GABARAP	H6UMI1	98 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	GABARAP	O95166	117 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	COX4I1	P13073	169 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	FXYD4	P59646	89 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE6	Q13070	117 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf83	Q53S99	150 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	ISOC2	Q96AB3	205 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0A6YYH2	397 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NJ64	397 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	SULT1A2	P50226	295 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SNAP23-223	ENST00000627440	CNIH2	Q6PI25	160 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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